L'explorateur Bruce Wayne, dont le passé est marqué par une succession de découvertes à la limite du mystère, revient dans l'enclave urbaine de Gotham après deux décennies d'absence inédite. Cette retraite s'est faite nécessaire, car son voyage a libéré un mal enfoui, qui se révèle être une force surnaturelle menaçant la ville et ses habitants. Ainsi, Bruce Wayne doit recourir à sa vie de Batman pour affronter ces nouvelles forces du chaos. Son adversaire est aussi un ancien allié devenu ennemi, mais pas seulement, car au sein même de l'ombre, il retrouve des anciens camarades et des personnes qu'il avait pensé avoir éliminé comme Green Arrow qui est devenu un stratège d'une grande efficacité, Ra's al Ghul, l'éternel ennemi de Batman, Mr. Freeze, un scientifique froid jusqu'aux os, Killer Croc, un adversaire particulièrement brutal et Double-Face, un personnage à la mentalité complètement détraquée, mais pas seulement ces personnages car James Gordon est aussi là, prêt à l'aider face au mal qui a envahi la ville