En 2012, les aventuriers du monde numérique de Digimon sont aux prises avec de nouvelles responsabilités. Les adolescents qui ont fait face à des défis épouvantables lorsqu'ils étaient plus jeunes doivent maintenant gérer leurs partenaires Digimon et prendre en compte leur destinée. Mais alors que tout semble stabilisé, un mystère émerge : Rui Owada, un jeune homme au passé inconnu, révèle avoir été le premier humain à faire la connaissance d'un Digimon, Ukkomon. Cette affirmation soulève de nombreuses questions. Est-il possible qu'il ait vraiment été le premier DigiDestined ? Quel est son lien avec les aventuriers du monde numérique et en quoi cela affecte-t-ille leurs vies ?