Dans un passé lointain, la communauté des Hunters fut scindée en deux camps antagonistes : les Résistants de la Lumière et les Ténèbres, chacun empruntant un chemin divergent. Le temps a ensuite passé, mais le côté obscur des Ténèbres est revenu à la charge contre Kirua et Kurapika, avec l'intention ferme d'éradiquer tous les Hunters encore en activité. Ce groupe sombre est dirigé par Jed, un individu qui entretient des liens étroits avec Netero, le président de l'Association des Hunters. Cette séparation déclenche une guerre sans merci entre les Hunters et leur facette sombre…