Dans le village de Konoha, deux années après les turbulences de la 4ème grande guerre des ninjas, l'hiver approche et Naruto s'apprête à célébrer la fête de l'hiver entouré de ses amis chers : Hinata, Shikamaru, Sakura. La soirée promet d'être joyeuse, mais soudainement, une météorite éclate dans le ciel nocturne, projetant une lumière intense qui perturbe la nuit paisible du village. Le Conseil des Kage se réunit aussitôt pour discuter de l'issue catastrophique qui menace la planète : la lune se rapproche à un rythme inédit de la Terre, menaçant de provoquer une catastrophe planétaire. Pour Naruto et ses amis les plus proches, le temps presse !