Jeune lycéen, Hodaka se retrouve seul à Tokyo après avoir quitté son île natale. Avec une poche vide et aucune perspective d'emploi, il doit faire preuve de créativité pour survivre dans cette jungle urbaine. Il finit par trouver un poste dans une revue qui explore les phénomènes paranormaux, ce qui lui permet de payer le loyer et quelques repas de temps en temps. Mais la vie est rude, et Hodaka doit faire preuve de réflexes pour ne pas sombrer dans l'abandon. C'est alors que se produit un événement inattendu : une tempête météorologique extrême frappe le Japon, emportant avec elle toutes les prévisions météo. Le gouvernement est dépassé, et il faut trouver une explication à ce phénomène inexplicable. Hodaka, curieux par nature, est dépêché pour enquêter sur l'existence de prêtresses du temps, des femmes censées avoir le pouvoir d'influencer les conditions météo. Il n'est pas convaincu que cette légende soit vraie, mais il décide tout de même d'y aller, peut-être parce qu'il a entendu parler d'une jeune fille qui aurait un lien avec ces prêtresses