Alice a survécu à l'horreur qui a dévasté le complexe scientifique d'Umbrella Corporation, mais elle n'est pas la seule rescapée... Un virus mortel a ravagé Raccoon et rien ne semble pouvoir s'y opposer. Avec un groupe de survivants, Alice, dont le métabolisme a mystérieusement été modifié, doit faire face à l'apocalypse. Ayant acquis de nouveaux pouvoirs, elle est plus puissante, ses sens sont surmultipliés et sa dextérité est ahurissante, mais ça ne sera pas suffisant... Elle est jointe dans son combat par Jill Valentine, une ancienne agent des forces spéciales d'Umbrella. Ensemble, elles vont tenter de résoudre les énigmes et affronter Némésis, un ennemi absolu lancé sur leurs traces