Orphelin à peine âgé, Peter Parker a été adopté par une famille aimante composée de son oncle Ben et sa tante May. Malgré cela, il se sent souvent exclu des activités scolaires de ses pairs. Son amour naissant pour Gwen Stacy l'oblige à réfléchir sur son propre identité et les secrets qui l'environnent. Sa quête pour comprendre le mystère entourant la disparition de ses parents, débouchera sur une découverte inattendue : une mallette mystérieuse que Peter découvre appartenait à son père. Cela va se terminer par sa confrontation avec Lézard, l'alter ego du docteur Curt Connors, un proche de ses parents disparus. Cette décision va décider de son destin…