Depuis les origines de la civilisation, Apocalypse a absorbé des pouvoirs exceptionnels, devenant à la fois immortel et invincible, ce qui lui vaut une adoration quasi-divin. Lorsqu'il s'éveille après un sommeil de plusieurs milliers d'années, il est profondément déçu par le monde qu'il découvre. Son désir de nettoyer l'humanité et régner sur un nouvel ordre l'amène à réunir des mutants puissants, dont Magneto, pour faire face à cette tâche. Cependant, deux figures s'opposent à son projet : Raven et le Professeur X, qui décident de se joindre pour affronter leur ennemi commun et sauver l'humanité d'une destruction totale