Hellboy, l'agent le plus impétueux du Bureau de Défense et Recherches Paranormales, est prêt à affronter un nouveau défi. Une menace obscure pèse sur notre monde, après que Nuada, Prince de la Nuit, a rompu le lien qui liait les humains aux Enfants de la Terre. Ce dernier compte utiliser cette liberté pour réveiller ses légions d'ombres et redonner à toutes les créatures surnaturelles leur autonomie. Hellboy préférait passer son temps en compagnie de sa petite amie pyrokinétique Liz et de leurs chats, mais il est le seul capable de sauver la Terre du chaos. Héros sans frontières, prisonnier de deux mondes qui ne l'acceptent pas, il doit faire son choix entre une vie connue et un destin inconnu, mais dont les étoiles sont déjà tracées