Dans un futur éclaté, après des siècles d'instabilité, le monde a finalement atteint une paix précaire. Mais les Terriens ont désespérément besoin de trouver un nouveau sens à leur existence. Pour apaiser ses citoyens, le gouvernement a mis en place un cycle de compétitions : celles-ci seront désormais organisées par des sociétés privées pour divertir la population.C'est alors que la dernière recrue à rejoindre les pilotes de Sky Crawlers se retrouve impliquée dans un nouveau projet secret, visant à donner aux pilotes une supériorité sur leurs adversaires