Au XVIIème siècle, deux prêtres jésuites, animés par une profonde dévotion, se lancent à l'aventure pour retrouver leur guide spirituel, le père Ferreira, qui s'était rendu au Japon avec l'intention de propager la foi catholique. Leur voyage sera marqué par des dangers insidieux et des épreuves redoutables. Lorsqu'ils finissent par atteindre le sol japonais, ils constatent que les enseignements du christianisme ont été décrétés comme une hérésie et que ses adeptes sont soumis à des persécutions sans merci. Devant ces réalités cruelles, les deux prêtres devront adopter une stratégie de discrétion afin de poursuivre leur quête difficile