Ce film est structuré en deux temps forts : La première partie, intitulée Death, fait le point sur les épisodes 1 à 24 de l'originalité du monde d'Eva. La seconde, baptisée Rebirth, s'appuie sur la version TV rénovée du 25ème épisode (l'épisode 25 TV complété avec une histoire inédite jusqu'alors), pour proposer un avant-goût de la suite à venir. La partie Death présente un montage original de la série TV originale, où se trouvent plusieurs scènes inédites qui ont été ajoutées dans sa version vidéo (sortie 2 ans après la première diffusion TV). La partie Rebirth n'est pas encore complète, car les créateurs du film n'ont pu terminer leur projet (épisodes 25' et 26'). Une décision a donc été prise de diffuser un premier film en mars, qui donnera le ton sur la suite à venir (la partie Rebirth), tandis qu'un deuxième volet sera dédié à une version complète du film